故事开头为7月13日(日文发音na i su,谐音nice)的一天早晨,晚起的真琴急急忙忙出门,明明该是美好的一天,早上却差点迟到,一到学校就有临时小考,家政料理课的天妇罗弄的一蹋糊涂,面临每个学生都会遇到的不知道要选理科还是文科,甚至忘了做值日生,当她送作业簿到理科教室的时候,听到阵阵怪声,明明是密室空间的教室里,却出现一道人影,吓得真琴跌倒撞到某样胡桃般的东西,瞬间,像是窥探了一个星球的记忆般的梦境。最后整个人跌躺在地上,人影不知去向。
当一切回到那一天,在真琴的努力助攻下学妹和功介有了顺利的进展。但如同片中出现多次“time waits for no one”,时间不会等待任何人,穿越时空的能力也不是无限使用的。
影片的最后终于揭示了真琴拥有时空穿越能力的真相,那个爱玩爱闹的红发少年千昭来自未来。不为她而来,却为她不想离开。为了避开最初那一天发生的事故和悲伤,千昭和真琴都用尽了最后一次穿越的机会。time waits for no one,来自未来的人不回到属于自己的时空将会消失,这一次真琴终于看清了自己的心意,那个总是在风里疾驰的女孩不再逃避,在耳边呼啸的风和在脑海里呼啸的回忆交织,原来那些共度的时光,早就铭刻在自己心底。